辦公室
負責機關公文、文秘、機要保密、檔案管理、公車管理、公務接待、后勤保障、干部人事管理、黨建、紀檢監察、精神文明建設、法治建設、財務、資產、信訪安全、史志、工會、婦女兒童、老干部等日常運轉和綜合事務;承擔機關重點工作的組織協調、督查督辦工作。
學會部
負貴所屬全市學會、協會、研究會的組織管理和黨建、業務指導工作:組織推進學會改革和學會建設,維護科技工作者合法權益;指導所屬學會、協會、研究會、高校科協開展學術交流研討活動;協調搭建科技工作者創新創業創造合作平臺,促進科技與經濟深度融合;支持所屬團體開展國際學術交流;負責全市自然科學優秀學術論文評選獎勵活動和科協系統人才工作。
普及部
協助政府有關部門制定科普工作政策和規劃,協調推進全民科學素質行動計劃綱要實施工作;指導所屬團體和基層科協開展科普工作,指導開展科普活動和青少年科技教育活動;會同有關部門組織實施面向農村、社區企業等科普示范項目;指導開展科技志愿服務,推動科普工作隊伍和科普信息化建設;指導全市科協系統科普設施、場所的規劃建設和管理工作。
宣傳咨詢部
負責科協系統新聞宣傳網絡平臺管理、信息公開工作;組織開展科學家精神宣傳,評選表彰、選樹宣傳優秀科技工作者;承擔意識形態工作責任制落實職責,推進科技倫理、科學道德和學風建設;指導科協系統智庫建設,開展科技工作者狀況調查研究,組織開展決策咨詢和建言獻策活動。